Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PSME1Q06323 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PSME1Q06323 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PSME1Q06323 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms