Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DEUP1Q05D60 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DEUP1Q05D60 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms