Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATP7AQ04656 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
ATP7AQ04656 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ATP7AQ04656 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms