Protein–RNA interactions for Protein: Q04304

YMR090W, UPF0659 protein YMR090W, yeast

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR090W	Q04304	PMT4	YJR143C	2289 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	NUS1	YDL193W	1128 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	BNA1	YJR025C	534 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	ANB1	YJR047C	474 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	YKR104W	YKR104W	921 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	YPL114W	YPL114W	420 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	NOG1	YPL093W	1944 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	TAF1	YGR274C	3201 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	ARO9	YHR137W	1542 nt		3.14	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	ECM34	YHL043W	513 nt		3.13	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	GEP4	YHR100C	558 nt		3.13	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	AIM22	YJL046W	1230 nt		3.13	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	TYW1	YPL207W	2433 nt		3.13	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	KRE29	YER038C	1395 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	PDR12	YPL058C	4536 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	FAR8	YMR029C	1572 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	XRS2	YDR369C	2565 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	ASI1	YMR119W	1875 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	TRX3	YCR083W	384 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	AIM7	YDR063W	450 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	AHA1	YDR214W	1053 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	YHR032C-A	YHR032C-A	120 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	OSW1	YOR255W	837 nt		3.12	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	MAL13	YGR288W	1422 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	NSP1	YJL041W	2472 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	ROD1	YOR018W	2514 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	RNA14	YMR061W	2034 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	YDL228C	YDL228C	642 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	KRE9	YJL174W	831 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	SCD6	YPR129W	1050 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	BUD5	YCR038C	1929 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	NTA1	YJR062C	1374 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	MCD4	YKL165C	2760 nt		3.11	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	CIT1	YNR001C	1440 nt		3.1	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	FLO10	YKR102W	3510 nt		3.1	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	BUD27	YFL023W	2391 nt		3.1	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	SNF11	YDR073W	510 nt		3.1	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	FDH1	YOR388C	1131 nt		3.1	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	YPS7	YDR349C	1791 nt		3.1	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	LOS1	YKL205W	3303 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	MDN1	YLR106C	14733 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	CWH43	YCR017C	2862 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	YEL053W-A	YEL053W-A	348 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	FAF1	YIL019W	1041 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	DPH1	YIL103W	1278 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	YKL162C-A	YKL162C-A	153 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	PAU17	YLL025W	375 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	WRS1	YOL097C	1299 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	YOR034C-A	YOR034C-A	243 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	SCP1	YOR367W	603 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	YBR103C-A	YBR103C-A	144 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	RAD54	YGL163C	2697 nt		3.09	□□□□□ -1.91
YMR090W	Q04304	TCB3	YML072C	4638 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	MNT4	YNR059W	1743 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	KIN4	YOR233W	2403 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	YNR042W	YNR042W	429 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	CDC45	YLR103C	1953 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	KRE5	YOR336W	4098 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	DHR2	YKL078W	2208 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	HPR1	YDR138W	2259 nt		3.08	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	RRP5	YMR229C	5190 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	MIG3	YER028C	1185 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	tV(CAC)D	tV(CAC)D	73 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	tV(CAC)H	tV(CAC)H	73 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	CDC8	YJR057W	651 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	COQ5	YML110C	924 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	YMR010W	YMR010W	1218 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	LCB2	YDR062W	1686 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	PPQ1	YPL179W	1650 nt		3.07	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	HEF3	YNL014W	3135 nt		3.06	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	PEP7	YDR323C	1548 nt		3.06	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	UBX5	YDR330W	1503 nt		3.06	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	GSC2	YGR032W	5688 nt		3.06	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	FRT2	YAL028W	1587 nt		3.06	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	IRC25	YLR021W	540 nt		3.06	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	RAD14	YMR201C	1116 nt		3.06	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	MED7	YOL135C	669 nt		3.06	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	YRM1	YOR172W	2361 nt		3.06	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	SEG1	YMR086W	2883 nt		3.06	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	SWI1	YPL016W	3945 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	TED1	YIL039W	1422 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	SSU1	YPL092W	1377 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	TMA17	YDL110C	453 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	PHM6	YDR281C	315 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	SHH3	YMR118C	591 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	RIM11	YMR139W	1113 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	YPR108W-A	YPR108W-A	213 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	APL4	YPR029C	2499 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	DPB2	YPR175W	2070 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	GCD1	YOR260W	1737 nt		3.05	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	DIT2	YDR402C	1470 nt		3.04	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	SMP1	YBR182C	1359 nt		3.04	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	YCR075W-A	YCR075W-A	228 nt		3.04	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	PDX1	YGR193C	1233 nt		3.04	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	CAP2	YIL034C	864 nt		3.04	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	IDH2	YOR136W	1110 nt		3.04	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	CTR1	YPR124W	1221 nt		3.04	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	DER1	YBR201W	636 nt		3.04	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	ARO80	YDR421W	2853 nt		3.04	□□□□□ -1.92
YMR090W	Q04304	STB3	YDR169C	1542 nt		3.03	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.5 ms