Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NHLH1Q02575 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms