Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SPTBN1Q01082 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SPTBN1Q01082 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms