Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BEX3Q00994 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEX3Q00994 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEX3Q00994 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEX3Q00994 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEX3Q00994 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEX3Q00994 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEX3Q00994 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BEX3Q00994 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEX3Q00994 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BEX3Q00994 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BEX3Q00994 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BEX3Q00994 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BEX3Q00994 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BEX3Q00994 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms