Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MDM2Q00987 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms