Protein–RNA interactions for Protein: Q00887

PSG9, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 9, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG9Q00887 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSG9Q00887 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSG9Q00887 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSG9Q00887 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSG9Q00887 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSG9Q00887 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSG9Q00887 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG9Q00887 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG9Q00887 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG9Q00887 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG9Q00887 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG9Q00887 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG9Q00887 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG9Q00887 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSG9Q00887 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PSG9Q00887 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms