Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGD1P98174 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGD1P98174 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGD1P98174 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGD1P98174 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGD1P98174 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FGD1P98174 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGD1P98174 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGD1P98174 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGD1P98174 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGD1P98174 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FGD1P98174 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD1P98174 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD1P98174 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD1P98174 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD1P98174 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD1P98174 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD1P98174 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD1P98174 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD1P98174 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD1P98174 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD1P98174 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD1P98174 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD1P98174 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FGD1P98174 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGD1P98174 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGD1P98174 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGD1P98174 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGD1P98174 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGD1P98174 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FGD1P98174 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGD1P98174 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FGD1P98174 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FGD1P98174 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FGD1P98174 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FGD1P98174 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FGD1P98174 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FGD1P98174 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FGD1P98174 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FGD1P98174 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FGD1P98174 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGD1P98174 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGD1P98174 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGD1P98174 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGD1P98174 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGD1P98174 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGD1P98174 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FGD1P98174 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGD1P98174 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGD1P98174 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGD1P98174 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGD1P98174 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGD1P98174 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGD1P98174 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGD1P98174 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGD1P98174 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGD1P98174 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGD1P98174 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGD1P98174 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD1P98174 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD1P98174 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD1P98174 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD1P98174 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD1P98174 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD1P98174 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD1P98174 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD1P98174 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD1P98174 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD1P98174 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD1P98174 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGD1P98174 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD1P98174 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD1P98174 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD1P98174 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD1P98174 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD1P98174 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD1P98174 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD1P98174 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD1P98174 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD1P98174 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGD1P98174 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGD1P98174 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGD1P98174 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGD1P98174 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGD1P98174 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGD1P98174 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD1P98174 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD1P98174 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD1P98174 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD1P98174 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD1P98174 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD1P98174 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD1P98174 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGD1P98174 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD1P98174 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD1P98174 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD1P98174 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD1P98174 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD1P98174 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGD1P98174 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms