Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED6P86452 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED6P86452 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED6P86452 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED6P86452 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED6P86452 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED6P86452 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED6P86452 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED6P86452 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED6P86452 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED6P86452 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED6P86452 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED6P86452 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED6P86452 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZBED6P86452 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED6P86452 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZBED6P86452 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms