Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX4P78413 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX4P78413 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX4P78413 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRX4P78413 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRX4P78413 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRX4P78413 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRX4P78413 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRX4P78413 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRX4P78413 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRX4P78413 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX4P78413 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX4P78413 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX4P78413 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX4P78413 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX4P78413 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX4P78413 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX4P78413 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX4P78413 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX4P78413 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX4P78413 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX4P78413 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX4P78413 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX4P78413 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX4P78413 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX4P78413 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX4P78413 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX4P78413 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX4P78413 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX4P78413 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX4P78413 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX4P78413 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX4P78413 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX4P78413 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX4P78413 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX4P78413 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX4P78413 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX4P78413 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX4P78413 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX4P78413 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX4P78413 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX4P78413 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX4P78413 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX4P78413 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX4P78413 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX4P78413 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX4P78413 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX4P78413 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX4P78413 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX4P78413 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX4P78413 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX4P78413 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX4P78413 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX4P78413 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX4P78413 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX4P78413 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX4P78413 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX4P78413 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX4P78413 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX4P78413 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX4P78413 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX4P78413 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX4P78413 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX4P78413 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX4P78413 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX4P78413 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX4P78413 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX4P78413 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX4P78413 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX4P78413 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRX4P78413 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX4P78413 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX4P78413 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX4P78413 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX4P78413 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX4P78413 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX4P78413 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX4P78413 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX4P78413 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX4P78413 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX4P78413 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX4P78413 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX4P78413 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX4P78413 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX4P78413 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRX4P78413 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX4P78413 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX4P78413 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX4P78413 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX4P78413 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX4P78413 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX4P78413 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX4P78413 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX4P78413 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX4P78413 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX4P78413 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX4P78413 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX4P78413 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX4P78413 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRX4P78413 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms