Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX6P78412 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX6P78412 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX6P78412 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX6P78412 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX6P78412 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IRX6P78412 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IRX6P78412 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IRX6P78412 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IRX6P78412 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IRX6P78412 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IRX6P78412 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IRX6P78412 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRX6P78412 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRX6P78412 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRX6P78412 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRX6P78412 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRX6P78412 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRX6P78412 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRX6P78412 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRX6P78412 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRX6P78412 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRX6P78412 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRX6P78412 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRX6P78412 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IRX6P78412 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IRX6P78412 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IRX6P78412 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IRX6P78412 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IRX6P78412 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IRX6P78412 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRX6P78412 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRX6P78412 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRX6P78412 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRX6P78412 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRX6P78412 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IRX6P78412 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
IRX6P78412 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRX6P78412 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRX6P78412 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRX6P78412 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRX6P78412 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRX6P78412 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRX6P78412 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRX6P78412 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRX6P78412 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IRX6P78412 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRX6P78412 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRX6P78412 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRX6P78412 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRX6P78412 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
IRX6P78412 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
IRX6P78412 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRX6P78412 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRX6P78412 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IRX6P78412 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IRX6P78412 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IRX6P78412 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IRX6P78412 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IRX6P78412 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IRX6P78412 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IRX6P78412 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX6P78412 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX6P78412 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX6P78412 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX6P78412 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX6P78412 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX6P78412 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX6P78412 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX6P78412 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX6P78412 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX6P78412 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IRX6P78412 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IRX6P78412 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IRX6P78412 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IRX6P78412 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
IRX6P78412 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IRX6P78412 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IRX6P78412 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IRX6P78412 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRX6P78412 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRX6P78412 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRX6P78412 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
IRX6P78412 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRX6P78412 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRX6P78412 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
IRX6P78412 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRX6P78412 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRX6P78412 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRX6P78412 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRX6P78412 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRX6P78412 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRX6P78412 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRX6P78412 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRX6P78412 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRX6P78412 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRX6P78412 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRX6P78412 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
IRX6P78412 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
IRX6P78412 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms