Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2IP63279 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2IP63279 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2IP63279 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2IP63279 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2IP63279 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2IP63279 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2IP63279 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2IP63279 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms