Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P62891 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P62891 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P62891 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P62891 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P62891 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P62891 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39P62891 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P62891 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P62891 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P62891 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P62891 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P62891 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P62891 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P62891 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P62891 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P62891 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P62891 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39P62891 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P62891 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P62891 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P62891 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P62891 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P62891 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P62891 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P62891 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P62891 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P62891 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P62891 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P62891 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P62891 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P62891 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P62891 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P62891 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39P62891 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P62891 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P62891 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P62891 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P62891 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P62891 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P62891 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P62891 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P62891 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P62891 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P62891 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P62891 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P62891 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P62891 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39P62891 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P62891 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P62891 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P62891 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P62891 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P62891 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P62891 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P62891 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P62891 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P62891 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P62891 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P62891 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P62891 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P62891 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P62891 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P62891 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P62891 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P62891 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P62891 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P62891 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39P62891 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P62891 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P62891 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P62891 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P62891 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P62891 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P62891 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P62891 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P62891 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P62891 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P62891 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P62891 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P62891 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P62891 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P62891 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P62891 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P62891 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39P62891 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL39P62891 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P62891 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P62891 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P62891 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P62891 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P62891 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P62891 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P62891 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P62891 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P62891 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P62891 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P62891 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39P62891 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39P62891 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms