Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB2AP61019 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB2AP61019 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms