Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FAM3BP58499 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3BP58499 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms