Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSDMDP57764 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GSDMDP57764 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GSDMDP57764 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms