Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP1P56182 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP1P56182 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP1P56182 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP1P56182 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP1P56182 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP1P56182 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP1P56182 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP1P56182 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP1P56182 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP1P56182 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP1P56182 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP1P56182 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP1P56182 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP1P56182 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP1P56182 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP1P56182 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP1P56182 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP1P56182 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP1P56182 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP1P56182 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP1P56182 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP1P56182 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP1P56182 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP1P56182 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP1P56182 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP1P56182 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP1P56182 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP1P56182 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP1P56182 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP1P56182 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP1P56182 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP1P56182 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP1P56182 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP1P56182 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP1P56182 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP1P56182 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP1P56182 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP1P56182 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP1P56182 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP1P56182 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP1P56182 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP1P56182 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP1P56182 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP1P56182 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP1P56182 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP1P56182 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP1P56182 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP1P56182 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP1P56182 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP1P56182 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP1P56182 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP1P56182 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP1P56182 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP1P56182 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP1P56182 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP1P56182 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP1P56182 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP1P56182 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP1P56182 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP1P56182 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP1P56182 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP1P56182 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP1P56182 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP1P56182 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP1P56182 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP1P56182 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP1P56182 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP1P56182 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP1P56182 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP1P56182 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP1P56182 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP1P56182 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP1P56182 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP1P56182 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP1P56182 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP1P56182 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP1P56182 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP1P56182 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP1P56182 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP1P56182 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP1P56182 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP1P56182 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP1P56182 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP1P56182 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP1P56182 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP1P56182 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP1P56182 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP1P56182 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP1P56182 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP1P56182 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP1P56182 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP1P56182 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP1P56182 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP1P56182 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP1P56182 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP1P56182 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP1P56182 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP1P56182 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP1P56182 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms