Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX9P55771 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX9P55771 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX9P55771 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX9P55771 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAX9P55771 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX9P55771 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX9P55771 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX9P55771 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX9P55771 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX9P55771 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX9P55771 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX9P55771 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX9P55771 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX9P55771 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX9P55771 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX9P55771 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX9P55771 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAX9P55771 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX9P55771 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX9P55771 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX9P55771 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX9P55771 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX9P55771 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX9P55771 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX9P55771 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX9P55771 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX9P55771 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX9P55771 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX9P55771 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX9P55771 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX9P55771 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAX9P55771 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAX9P55771 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAX9P55771 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAX9P55771 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAX9P55771 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAX9P55771 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAX9P55771 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PAX9P55771 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAX9P55771 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAX9P55771 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAX9P55771 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PAX9P55771 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX9P55771 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX9P55771 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX9P55771 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX9P55771 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX9P55771 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX9P55771 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX9P55771 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX9P55771 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX9P55771 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX9P55771 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX9P55771 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX9P55771 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PAX9P55771 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX9P55771 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX9P55771 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX9P55771 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX9P55771 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX9P55771 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX9P55771 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX9P55771 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX9P55771 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX9P55771 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX9P55771 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX9P55771 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PAX9P55771 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX9P55771 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX9P55771 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX9P55771 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX9P55771 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX9P55771 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX9P55771 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX9P55771 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX9P55771 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PAX9P55771 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX9P55771 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX9P55771 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX9P55771 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX9P55771 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX9P55771 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX9P55771 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX9P55771 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX9P55771 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX9P55771 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX9P55771 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX9P55771 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX9P55771 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX9P55771 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX9P55771 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX9P55771 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PAX9P55771 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX9P55771 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX9P55771 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX9P55771 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX9P55771 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX9P55771 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAX9P55771 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms