Protein–RNA interactions for Protein: P55056

APOC4, Apolipoprotein C-IV, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4P55056 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4P55056 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4P55056 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC4P55056 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC4P55056 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4P55056 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4P55056 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4P55056 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4P55056 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4P55056 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4P55056 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4P55056 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4P55056 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4P55056 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4P55056 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4P55056 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4P55056 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4P55056 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4P55056 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4P55056 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4P55056 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4P55056 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4P55056 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4P55056 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC4P55056 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4P55056 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4P55056 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4P55056 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4P55056 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4P55056 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4P55056 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4P55056 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4P55056 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4P55056 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4P55056 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4P55056 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4P55056 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4P55056 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4P55056 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOC4P55056 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOC4P55056 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4P55056 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4P55056 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4P55056 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4P55056 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4P55056 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4P55056 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4P55056 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4P55056 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4P55056 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4P55056 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4P55056 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4P55056 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4P55056 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4P55056 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4P55056 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4P55056 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4P55056 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4P55056 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOC4P55056 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4P55056 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4P55056 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4P55056 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4P55056 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4P55056 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4P55056 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4P55056 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4P55056 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4P55056 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4P55056 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4P55056 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4P55056 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4P55056 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4P55056 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4P55056 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4P55056 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4P55056 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOC4P55056 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4P55056 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOC4P55056 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.4 ms