Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMP3P54852 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMP3P54852 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMP3P54852 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMP3P54852 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMP3P54852 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMP3P54852 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMP3P54852 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMP3P54852 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMP3P54852 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMP3P54852 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMP3P54852 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMP3P54852 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EMP3P54852 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMP3P54852 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMP3P54852 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMP3P54852 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMP3P54852 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMP3P54852 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMP3P54852 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMP3P54852 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMP3P54852 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EMP3P54852 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMP3P54852 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMP3P54852 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EMP3P54852 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMP3P54852 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMP3P54852 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMP3P54852 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMP3P54852 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMP3P54852 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMP3P54852 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMP3P54852 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EMP3P54852 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMP3P54852 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMP3P54852 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMP3P54852 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMP3P54852 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EMP3P54852 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMP3P54852 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EMP3P54852 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMP3P54852 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMP3P54852 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMP3P54852 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMP3P54852 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMP3P54852 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMP3P54852 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMP3P54852 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMP3P54852 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMP3P54852 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMP3P54852 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMP3P54852 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMP3P54852 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMP3P54852 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EMP3P54852 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMP3P54852 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMP3P54852 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMP3P54852 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMP3P54852 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMP3P54852 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMP3P54852 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMP3P54852 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMP3P54852 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMP3P54852 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMP3P54852 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMP3P54852 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMP3P54852 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EMP3P54852 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMP3P54852 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMP3P54852 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMP3P54852 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMP3P54852 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMP3P54852 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMP3P54852 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMP3P54852 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMP3P54852 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMP3P54852 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMP3P54852 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMP3P54852 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMP3P54852 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMP3P54852 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMP3P54852 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMP3P54852 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMP3P54852 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMP3P54852 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMP3P54852 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMP3P54852 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMP3P54852 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMP3P54852 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMP3P54852 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMP3P54852 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EMP3P54852 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMP3P54852 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMP3P54852 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EMP3P54852 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EMP3P54852 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMP3P54852 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMP3P54852 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EMP3P54852 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMP3P54852 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms