Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRLP54845 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRLP54845 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRLP54845 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRLP54845 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRLP54845 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRLP54845 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRLP54845 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRLP54845 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRLP54845 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRLP54845 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NRLP54845 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRLP54845 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRLP54845 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRLP54845 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NRLP54845 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRLP54845 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRLP54845 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRLP54845 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRLP54845 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NRLP54845 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRLP54845 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NRLP54845 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRLP54845 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRLP54845 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRLP54845 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRLP54845 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRLP54845 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRLP54845 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRLP54845 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRLP54845 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRLP54845 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRLP54845 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRLP54845 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRLP54845 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NRLP54845 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRLP54845 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRLP54845 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRLP54845 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRLP54845 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRLP54845 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRLP54845 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRLP54845 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRLP54845 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NRLP54845 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NRLP54845 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRLP54845 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRLP54845 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRLP54845 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRLP54845 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRLP54845 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRLP54845 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NRLP54845 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRLP54845 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRLP54845 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRLP54845 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRLP54845 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRLP54845 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRLP54845 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRLP54845 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRLP54845 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRLP54845 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRLP54845 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRLP54845 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRLP54845 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRLP54845 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRLP54845 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRLP54845 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRLP54845 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRLP54845 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRLP54845 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRLP54845 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRLP54845 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRLP54845 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRLP54845 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRLP54845 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRLP54845 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRLP54845 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NRLP54845 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRLP54845 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRLP54845 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRLP54845 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRLP54845 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRLP54845 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRLP54845 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRLP54845 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRLP54845 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRLP54845 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRLP54845 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRLP54845 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRLP54845 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRLP54845 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRLP54845 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRLP54845 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRLP54845 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRLP54845 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRLP54845 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRLP54845 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRLP54845 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRLP54845 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms