Protein–RNA interactions for Protein: P53855

ATG2, Autophagy-related protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG2P53855 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt5.46□□□□□ -1.54
ATG2P53855 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt5.46□□□□□ -1.54
ATG2P53855 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt5.46□□□□□ -1.54
ATG2P53855 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt5.46□□□□□ -1.54
ATG2P53855 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt5.46□□□□□ -1.54
ATG2P53855 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt5.46□□□□□ -1.54
ATG2P53855 RPS9BYBR189W 588 nt5.46□□□□□ -1.54
ATG2P53855 snR42snR42 351 nt5.46□□□□□ -1.54
ATG2P53855 PDR12YPL058C 4536 nt5.45□□□□□ -1.54
ATG2P53855 HAT2YEL056W 1206 nt5.45□□□□□ -1.54
ATG2P53855 MRP13YGR084C 1020 nt5.44□□□□□ -1.54
ATG2P53855 SNF2YOR290C 5112 nt5.44□□□□□ -1.54
ATG2P53855 BMH2YDR099W 822 nt5.43□□□□□ -1.54
ATG2P53855 SAS10YDL153C 1833 nt5.43□□□□□ -1.54
ATG2P53855 ECM16YMR128W 3804 nt5.42□□□□□ -1.54
ATG2P53855 TED1YIL039W 1422 nt5.42□□□□□ -1.54
ATG2P53855 LEU1YGL009C 2340 nt5.42□□□□□ -1.54
ATG2P53855 TMA10YLR327C 261 nt5.42□□□□□ -1.54
ATG2P53855 ELM1YKL048C 1923 nt5.41□□□□□ -1.54
ATG2P53855 SHO1YER118C 1104 nt5.41□□□□□ -1.54
ATG2P53855 EXO1YOR033C 2109 nt5.41□□□□□ -1.54
ATG2P53855 MCX1YBR227C 1563 nt5.4□□□□□ -1.54
ATG2P53855 TEM1YML064C 738 nt5.4□□□□□ -1.55
ATG2P53855 SGT1YOR057W 1188 nt5.4□□□□□ -1.55
ATG2P53855 CHL4YDR254W 1377 nt5.4□□□□□ -1.55
ATG2P53855 NOP4YPL043W 2058 nt5.4□□□□□ -1.55
ATG2P53855 YHR202WYHR202W 1809 nt5.4□□□□□ -1.55
ATG2P53855 YMR317WYMR317W 3423 nt5.39□□□□□ -1.55
ATG2P53855 TEL2YGR099W 2067 nt5.39□□□□□ -1.55
ATG2P53855 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt5.39□□□□□ -1.55
ATG2P53855 MDM12YOL009C 816 nt5.39□□□□□ -1.55
ATG2P53855 PBP2YBR233W 1242 nt5.39□□□□□ -1.55
ATG2P53855 SOF1YLL011W 1470 nt5.39□□□□□ -1.55
ATG2P53855 BUD27YFL023W 2391 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG2P53855 PEA2YER149C 1263 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG2P53855 YGL108CYGL108C 423 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG2P53855 ATG11YPR049C 3537 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG2P53855 NHP10YDL002C 612 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG2P53855 ARR1YPR199C 885 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG2P53855 MIS1YBR084W 2928 nt5.37□□□□□ -1.55
ATG2P53855 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.37□□□□□ -1.55
ATG2P53855 YHL026CYHL026C 948 nt5.37□□□□□ -1.55
ATG2P53855 URA7YBL039C 1740 nt5.37□□□□□ -1.55
ATG2P53855 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt5.37□□□□□ -1.55
ATG2P53855 ECM32YER176W 3366 nt5.36□□□□□ -1.55
ATG2P53855 FAD1YDL045C 921 nt5.36□□□□□ -1.55
ATG2P53855 DRS2YAL026C 4068 nt5.36□□□□□ -1.55
ATG2P53855 NGL2YMR285C 1548 nt5.35□□□□□ -1.55
ATG2P53855 IRC18YJL037W 675 nt5.35□□□□□ -1.55
ATG2P53855 DNA2YHR164C 4569 nt5.35□□□□□ -1.55
ATG2P53855 SWP82YFL049W 1872 nt5.35□□□□□ -1.55
ATG2P53855 MKC7YDR144C 1791 nt5.34□□□□□ -1.55
ATG2P53855 YRA2YKL214C 612 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG2P53855 YPT7YML001W 627 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG2P53855 ORC1YML065W 2745 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG2P53855 YTA6YPL074W 2265 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG2P53855 SUB2YDL084W 1341 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG2P53855 TPO2YGR138C 1845 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG2P53855 CWC27YPL064C 906 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG2P53855 TCB2YNL087W 3537 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG2P53855 YJL218WYJL218W 591 nt5.32□□□□□ -1.56
ATG2P53855 ERG2YMR202W 669 nt5.32□□□□□ -1.56
ATG2P53855 NTO1YPR031W 2247 nt5.32□□□□□ -1.56
ATG2P53855 HSP42YDR171W 1128 nt5.31□□□□□ -1.56
ATG2P53855 GOT1YMR292W 417 nt5.31□□□□□ -1.56
ATG2P53855 YND1YER005W 1893 nt5.31□□□□□ -1.56
ATG2P53855 GAC1YOR178C 2382 nt5.31□□□□□ -1.56
ATG2P53855 PCA1YBR295W 3651 nt5.3□□□□□ -1.56
ATG2P53855 YJR020WYJR020W 333 nt5.3□□□□□ -1.56
ATG2P53855 MRPS35YGR165W 1038 nt5.29□□□□□ -1.56
ATG2P53855 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt5.29□□□□□ -1.56
ATG2P53855 PRE8YML092C 753 nt5.29□□□□□ -1.56
ATG2P53855 YNL320WYNL320W 855 nt5.29□□□□□ -1.56
ATG2P53855 RRN7YJL025W 1545 nt5.29□□□□□ -1.56
ATG2P53855 FLC3YGL139W 2409 nt5.29□□□□□ -1.56
ATG2P53855 GSC2YGR032W 5688 nt5.29□□□□□ -1.56
ATG2P53855 INN1YNL152W 1230 nt5.29□□□□□ -1.56
ATG2P53855 RUF5-1RUF5-1 710 nt5.29□□□□□ -1.56
ATG2P53855 RUF5-2RUF5-2 710 nt5.29□□□□□ -1.56
ATG2P53855 PAP1YKR002W 1707 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG2P53855 RSE1YML049C 4086 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG2P53855 RAD53YPL153C 2466 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG2P53855 RTK1YDL025C 1863 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG2P53855 RPL34AYER056C-A 366 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG2P53855 ARO4YBR249C 1113 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG2P53855 SET5YHR207C 1581 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG2P53855 NUP60YAR002W 1620 nt5.27□□□□□ -1.57
ATG2P53855 ECM34YHL043W 513 nt5.27□□□□□ -1.57
ATG2P53855 UTP23YOR004W 765 nt5.27□□□□□ -1.57
ATG2P53855 VBA1YMR088C 1689 nt5.27□□□□□ -1.57
ATG2P53855 ENA2YDR039C 3276 nt5.27□□□□□ -1.57
ATG2P53855 ENA1YDR040C 3276 nt5.27□□□□□ -1.57
ATG2P53855 RAD54YGL163C 2697 nt5.26□□□□□ -1.57
ATG2P53855 NUS1YDL193W 1128 nt5.26□□□□□ -1.57
ATG2P53855 TPM1YNL079C 600 nt5.26□□□□□ -1.57
ATG2P53855 YBL108WYBL108W 306 nt5.26□□□□□ -1.57
ATG2P53855 CFD1YIL003W 882 nt5.25□□□□□ -1.57
ATG2P53855 NRM1YNR009W 750 nt5.25□□□□□ -1.57
ATG2P53855 MED7YOL135C 669 nt5.25□□□□□ -1.57
ATG2P53855 RPS8BYER102W 603 nt5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45 ms