Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUBP1P53384 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUBP1P53384 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms