Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2D1P51668 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms