Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATP1A2P50993 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1A2P50993 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms