Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IDH3AP50213 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IDH3AP50213 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms