Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUMBP49757 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUMBP49757 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUMBP49757 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUMBP49757 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUMBP49757 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUMBP49757 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUMBP49757 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUMBP49757 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUMBP49757 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUMBP49757 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUMBP49757 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUMBP49757 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUMBP49757 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUMBP49757 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUMBP49757 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUMBP49757 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUMBP49757 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUMBP49757 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUMBP49757 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUMBP49757 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUMBP49757 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUMBP49757 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUMBP49757 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUMBP49757 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUMBP49757 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUMBP49757 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUMBP49757 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUMBP49757 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUMBP49757 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUMBP49757 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUMBP49757 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUMBP49757 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUMBP49757 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUMBP49757 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUMBP49757 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUMBP49757 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUMBP49757 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUMBP49757 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUMBP49757 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUMBP49757 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUMBP49757 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUMBP49757 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUMBP49757 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUMBP49757 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUMBP49757 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUMBP49757 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NUMBP49757 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUMBP49757 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUMBP49757 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUMBP49757 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUMBP49757 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUMBP49757 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUMBP49757 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUMBP49757 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUMBP49757 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUMBP49757 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NUMBP49757 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUMBP49757 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUMBP49757 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUMBP49757 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUMBP49757 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUMBP49757 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUMBP49757 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUMBP49757 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUMBP49757 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUMBP49757 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUMBP49757 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUMBP49757 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUMBP49757 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUMBP49757 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUMBP49757 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUMBP49757 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUMBP49757 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NUMBP49757 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUMBP49757 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUMBP49757 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUMBP49757 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUMBP49757 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUMBP49757 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUMBP49757 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUMBP49757 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUMBP49757 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUMBP49757 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUMBP49757 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUMBP49757 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUMBP49757 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUMBP49757 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUMBP49757 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUMBP49757 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUMBP49757 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUMBP49757 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUMBP49757 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUMBP49757 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUMBP49757 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUMBP49757 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUMBP49757 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUMBP49757 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUMBP49757 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUMBP49757 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms