Protein–RNA interactions for Protein: P49019

HCAR3, Hydroxycarboxylic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR3P49019 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCAR3P49019 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms