Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMUP48645 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMUP48645 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMUP48645 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMUP48645 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMUP48645 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMUP48645 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMUP48645 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMUP48645 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMUP48645 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMUP48645 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMUP48645 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMUP48645 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMUP48645 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMUP48645 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMUP48645 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMUP48645 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMUP48645 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMUP48645 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMUP48645 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMUP48645 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMUP48645 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NMUP48645 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMUP48645 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMUP48645 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMUP48645 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMUP48645 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMUP48645 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NMUP48645 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMUP48645 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMUP48645 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMUP48645 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMUP48645 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMUP48645 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMUP48645 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMUP48645 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMUP48645 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NMUP48645 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMUP48645 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMUP48645 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMUP48645 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMUP48645 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMUP48645 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMUP48645 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMUP48645 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMUP48645 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMUP48645 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMUP48645 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMUP48645 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMUP48645 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMUP48645 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMUP48645 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMUP48645 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMUP48645 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NMUP48645 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NMUP48645 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NMUP48645 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMUP48645 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMUP48645 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMUP48645 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMUP48645 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMUP48645 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMUP48645 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMUP48645 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMUP48645 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMUP48645 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMUP48645 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NMUP48645 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMUP48645 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMUP48645 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMUP48645 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMUP48645 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMUP48645 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMUP48645 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMUP48645 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMUP48645 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMUP48645 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMUP48645 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMUP48645 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NMUP48645 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMUP48645 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMUP48645 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMUP48645 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMUP48645 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMUP48645 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMUP48645 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMUP48645 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMUP48645 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMUP48645 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMUP48645 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMUP48645 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMUP48645 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMUP48645 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMUP48645 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NMUP48645 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NMUP48645 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms