Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCLCP48506 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCLCP48506 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCLCP48506 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCLCP48506 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCLCP48506 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCLCP48506 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCLCP48506 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCLCP48506 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCLCP48506 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCLCP48506 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCLCP48506 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCLCP48506 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCLCP48506 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GCLCP48506 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GCLCP48506 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GCLCP48506 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCLCP48506 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCLCP48506 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCLCP48506 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCLCP48506 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCLCP48506 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GCLCP48506 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCLCP48506 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCLCP48506 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCLCP48506 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GCLCP48506 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCLCP48506 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCLCP48506 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCLCP48506 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCLCP48506 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCLCP48506 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCLCP48506 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCLCP48506 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCLCP48506 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCLCP48506 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCLCP48506 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCLCP48506 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCLCP48506 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCLCP48506 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GCLCP48506 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCLCP48506 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCLCP48506 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCLCP48506 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCLCP48506 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCLCP48506 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GCLCP48506 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCLCP48506 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCLCP48506 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCLCP48506 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCLCP48506 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCLCP48506 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCLCP48506 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCLCP48506 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCLCP48506 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCLCP48506 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCLCP48506 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCLCP48506 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GCLCP48506 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCLCP48506 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCLCP48506 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCLCP48506 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCLCP48506 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCLCP48506 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCLCP48506 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCLCP48506 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCLCP48506 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCLCP48506 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCLCP48506 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCLCP48506 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCLCP48506 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCLCP48506 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCLCP48506 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCLCP48506 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCLCP48506 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCLCP48506 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCLCP48506 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCLCP48506 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GCLCP48506 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCLCP48506 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLCP48506 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLCP48506 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLCP48506 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLCP48506 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLCP48506 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLCP48506 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLCP48506 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLCP48506 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLCP48506 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLCP48506 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLCP48506 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLCP48506 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLCP48506 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCLCP48506 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCLCP48506 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCLCP48506 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCLCP48506 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GCLCP48506 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCLCP48506 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCLCP48506 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms