Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC6A11P48066 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A11P48066 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms