Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPTX2P47972 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPTX2P47972 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPTX2P47972 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms