Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEDD4P46934 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEDD4P46934 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEDD4P46934 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms