Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETV4P43268 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ETV4P43268 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETV4P43268 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETV4P43268 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ETV4P43268 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETV4P43268 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETV4P43268 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETV4P43268 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETV4P43268 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETV4P43268 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETV4P43268 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETV4P43268 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETV4P43268 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETV4P43268 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETV4P43268 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETV4P43268 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETV4P43268 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETV4P43268 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETV4P43268 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETV4P43268 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETV4P43268 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETV4P43268 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETV4P43268 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ETV4P43268 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ETV4P43268 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ETV4P43268 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ETV4P43268 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETV4P43268 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETV4P43268 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETV4P43268 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETV4P43268 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETV4P43268 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETV4P43268 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETV4P43268 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETV4P43268 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETV4P43268 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETV4P43268 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETV4P43268 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETV4P43268 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETV4P43268 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETV4P43268 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETV4P43268 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETV4P43268 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETV4P43268 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETV4P43268 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETV4P43268 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETV4P43268 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETV4P43268 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETV4P43268 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETV4P43268 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETV4P43268 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETV4P43268 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETV4P43268 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETV4P43268 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETV4P43268 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ETV4P43268 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETV4P43268 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETV4P43268 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETV4P43268 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETV4P43268 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETV4P43268 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETV4P43268 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETV4P43268 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETV4P43268 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETV4P43268 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV4P43268 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV4P43268 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV4P43268 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV4P43268 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV4P43268 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV4P43268 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV4P43268 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV4P43268 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV4P43268 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV4P43268 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV4P43268 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ETV4P43268 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ETV4P43268 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ETV4P43268 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ETV4P43268 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ETV4P43268 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ETV4P43268 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ETV4P43268 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ETV4P43268 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ETV4P43268 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ETV4P43268 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ETV4P43268 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ETV4P43268 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ETV4P43268 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ETV4P43268 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ETV4P43268 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ETV4P43268 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ETV4P43268 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ETV4P43268 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ETV4P43268 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ETV4P43268 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ETV4P43268 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ETV4P43268 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ETV4P43268 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms