Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTGER2P43116 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTGER2P43116 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTGER2P43116 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms