Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP2P42575 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP2P42575 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP2P42575 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP2P42575 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP2P42575 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP2P42575 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP2P42575 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP2P42575 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP2P42575 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP2P42575 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP2P42575 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP2P42575 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP2P42575 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP2P42575 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP2P42575 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP2P42575 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP2P42575 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP2P42575 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP2P42575 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP2P42575 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP2P42575 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP2P42575 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP2P42575 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP2P42575 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP2P42575 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP2P42575 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP2P42575 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP2P42575 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP2P42575 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP2P42575 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP2P42575 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP2P42575 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP2P42575 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP2P42575 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP2P42575 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP2P42575 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP2P42575 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP2P42575 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP2P42575 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP2P42575 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP2P42575 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASP2P42575 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASP2P42575 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASP2P42575 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP2P42575 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP2P42575 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP2P42575 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP2P42575 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP2P42575 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP2P42575 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP2P42575 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP2P42575 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP2P42575 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP2P42575 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP2P42575 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP2P42575 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP2P42575 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP2P42575 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP2P42575 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP2P42575 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP2P42575 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP2P42575 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP2P42575 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP2P42575 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP2P42575 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP2P42575 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP2P42575 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP2P42575 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP2P42575 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP2P42575 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP2P42575 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP2P42575 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP2P42575 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP2P42575 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP2P42575 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP2P42575 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP2P42575 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP2P42575 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP2P42575 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP2P42575 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP2P42575 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP2P42575 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP2P42575 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP2P42575 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP2P42575 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP2P42575 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP2P42575 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP2P42575 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP2P42575 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP2P42575 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP2P42575 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP2P42575 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP2P42575 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASP2P42575 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP2P42575 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP2P42575 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP2P42575 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP2P42575 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASP2P42575 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms