Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOBEC1P41238 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms