Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM5CP41229 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
KDM5CP41229 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KDM5CP41229 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms