Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 ECM23YPL021W 564 nt5.15□□□□□ -1.59
VID28P40547 TRM13YOL125W 1431 nt5.14□□□□□ -1.59
VID28P40547 PAH1YMR165C 2589 nt5.14□□□□□ -1.59
VID28P40547 OCT1YKL134C 2319 nt5.14□□□□□ -1.59
VID28P40547 BUD16YEL029C 939 nt5.14□□□□□ -1.59
VID28P40547 YAL064WYAL064W 285 nt5.14□□□□□ -1.59
VID28P40547 LIP2YLR239C 987 nt5.14□□□□□ -1.59
VID28P40547 YLR365WYLR365W 333 nt5.14□□□□□ -1.59
VID28P40547 FBP1YLR377C 1047 nt5.14□□□□□ -1.59
VID28P40547 COG5YNL051W 1212 nt5.14□□□□□ -1.59
VID28P40547 AIM39YOL053W 1188 nt5.14□□□□□ -1.59
VID28P40547 ARC40YBR234C 1155 nt5.14□□□□□ -1.59
VID28P40547 YER158CYER158C 1722 nt5.14□□□□□ -1.59
VID28P40547 GAS5YOL030W 1455 nt5.13□□□□□ -1.59
VID28P40547 PEX29YDR479C 1665 nt5.13□□□□□ -1.59
VID28P40547 YPR1YDR368W 939 nt5.13□□□□□ -1.59
VID28P40547 YGL218WYGL218W 651 nt5.13□□□□□ -1.59
VID28P40547 RFC2YJR068W 1062 nt5.13□□□□□ -1.59
VID28P40547 TEF4YKL081W 1239 nt5.13□□□□□ -1.59
VID28P40547 SIC1YLR079W 855 nt5.13□□□□□ -1.59
VID28P40547 POP8YBL018C 402 nt5.13□□□□□ -1.59
VID28P40547 YIM1YMR152W 1098 nt5.13□□□□□ -1.59
VID28P40547 CDC21YOR074C 915 nt5.13□□□□□ -1.59
VID28P40547 SMA1YPL027W 738 nt5.13□□□□□ -1.59
VID28P40547 ARG4YHR018C 1392 nt5.13□□□□□ -1.59
VID28P40547 SAF1YBR280C 1914 nt5.13□□□□□ -1.59
VID28P40547 IMD2YHR216W 1572 nt5.12□□□□□ -1.59
VID28P40547 CPR4YCR069W 957 nt5.12□□□□□ -1.59
VID28P40547 ACT1YFL039C 1128 nt5.12□□□□□ -1.59
VID28P40547 YGR079WYGR079W 1113 nt5.12□□□□□ -1.59
VID28P40547 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt5.12□□□□□ -1.59
VID28P40547 YLR462WYLR462W 609 nt5.12□□□□□ -1.59
VID28P40547 CPR8YNR028W 927 nt5.12□□□□□ -1.59
VID28P40547 CSH1YBR161W 1131 nt5.12□□□□□ -1.59
VID28P40547 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt5.12□□□□□ -1.59
VID28P40547 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt5.12□□□□□ -1.59
VID28P40547 RIP1YEL024W 648 nt5.11□□□□□ -1.59
VID28P40547 YIL165CYIL165C 360 nt5.11□□□□□ -1.59
VID28P40547 MTD1YKR080W 963 nt5.11□□□□□ -1.59
VID28P40547 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt5.11□□□□□ -1.59
VID28P40547 MER1YNL210W 813 nt5.11□□□□□ -1.59
VID28P40547 BUD17YNR027W 954 nt5.11□□□□□ -1.59
VID28P40547 YOL118CYOL118C 309 nt5.11□□□□□ -1.59
VID28P40547 YPR142CYPR142C 564 nt5.11□□□□□ -1.59
VID28P40547 ALD3YMR169C 1521 nt5.11□□□□□ -1.59
VID28P40547 ALD2YMR170C 1521 nt5.11□□□□□ -1.59
VID28P40547 RRP8YDR083W 1179 nt5.1□□□□□ -1.59
VID28P40547 SPR6YER115C 576 nt5.1□□□□□ -1.59
VID28P40547 CAX4YGR036C 720 nt5.1□□□□□ -1.59
VID28P40547 COX18YGR062C 951 nt5.1□□□□□ -1.59
VID28P40547 NAT2YGR147C 867 nt5.1□□□□□ -1.59
VID28P40547 PEX21YGR239C 867 nt5.1□□□□□ -1.59
VID28P40547 YNL217WYNL217W 981 nt5.1□□□□□ -1.59
VID28P40547 ECM8YBR076W 1065 nt5.1□□□□□ -1.59
VID28P40547 GPR1YDL035C 2886 nt5.1□□□□□ -1.59
VID28P40547 MCM4YPR019W 2802 nt5.1□□□□□ -1.59
VID28P40547 STR2YJR130C 1920 nt5.09□□□□□ -1.59
VID28P40547 MDM38YOL027C 1722 nt5.09□□□□□ -1.59
VID28P40547 STB3YDR169C 1542 nt5.09□□□□□ -1.59
VID28P40547 RPN6YDL097C 1305 nt5.09□□□□□ -1.59
VID28P40547 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt5.09□□□□□ -1.59
VID28P40547 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt5.09□□□□□ -1.59
VID28P40547 HIM1YDR317W 1245 nt5.09□□□□□ -1.59
VID28P40547 YGR149WYGR149W 1299 nt5.09□□□□□ -1.59
VID28P40547 SUI2YJR007W 915 nt5.09□□□□□ -1.59
VID28P40547 CMR3YPR013C 954 nt5.09□□□□□ -1.59
VID28P40547 MDL1YLR188W 2088 nt5.09□□□□□ -1.59
VID28P40547 EAR1YMR171C 1653 nt5.08□□□□□ -1.6
VID28P40547 YER145C-AYER145C-A 438 nt5.08□□□□□ -1.6
VID28P40547 ACP1YKL192C 378 nt5.08□□□□□ -1.6
VID28P40547 YNR061CYNR061C 660 nt5.08□□□□□ -1.6
VID28P40547 YOL107WYOL107W 1029 nt5.08□□□□□ -1.6
VID28P40547 PNT1YOR266W 1272 nt5.08□□□□□ -1.6
VID28P40547 SET6YPL165C 1122 nt5.08□□□□□ -1.6
VID28P40547 MUM2YBR057C 1101 nt5.08□□□□□ -1.6
VID28P40547 ICY2YPL250C 411 nt5.08□□□□□ -1.6
VID28P40547 CNS1YBR155W 1158 nt5.08□□□□□ -1.6
VID28P40547 TRM1YDR120C 1713 nt5.08□□□□□ -1.6
VID28P40547 VHC1YBR235W 3363 nt5.08□□□□□ -1.6
VID28P40547 YMR221CYMR221C 1515 nt5.07□□□□□ -1.6
VID28P40547 CEG1YGL130W 1380 nt5.07□□□□□ -1.6
VID28P40547 SRO9YCL037C 1305 nt5.07□□□□□ -1.6
VID28P40547 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt5.07□□□□□ -1.6
VID28P40547 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt5.07□□□□□ -1.6
VID28P40547 RPL34AYER056C-A 366 nt5.07□□□□□ -1.6
VID28P40547 YGR122WYGR122W 1209 nt5.07□□□□□ -1.6
VID28P40547 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt5.07□□□□□ -1.6
VID28P40547 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt5.07□□□□□ -1.6
VID28P40547 TVP38YKR088C 1014 nt5.07□□□□□ -1.6
VID28P40547 CPR3YML078W 549 nt5.07□□□□□ -1.6
VID28P40547 MDJ2YNL328C 441 nt5.07□□□□□ -1.6
VID28P40547 IZH4YOL101C 939 nt5.07□□□□□ -1.6
VID28P40547 TMA16YOR252W 537 nt5.07□□□□□ -1.6
VID28P40547 PEP4YPL154C 1218 nt5.07□□□□□ -1.6
VID28P40547 TAZ1YPR140W 1146 nt5.07□□□□□ -1.6
VID28P40547 MET12YPL023C 1974 nt5.07□□□□□ -1.6
VID28P40547 KCH1YJR054W 1494 nt5.07□□□□□ -1.6
VID28P40547 IMA3YIL172C 1770 nt5.06□□□□□ -1.6
VID28P40547 IMA4YJL221C 1770 nt5.06□□□□□ -1.6
VID28P40547 NPL4YBR170C 1743 nt5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.2 ms