Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX1P40424 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX1P40424 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX1P40424 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX1P40424 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX1P40424 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX1P40424 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX1P40424 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX1P40424 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX1P40424 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX1P40424 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX1P40424 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX1P40424 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX1P40424 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX1P40424 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX1P40424 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX1P40424 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX1P40424 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX1P40424 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PBX1P40424 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX1P40424 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX1P40424 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX1P40424 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX1P40424 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX1P40424 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX1P40424 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX1P40424 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX1P40424 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX1P40424 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX1P40424 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX1P40424 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX1P40424 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX1P40424 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX1P40424 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX1P40424 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX1P40424 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX1P40424 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX1P40424 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX1P40424 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX1P40424 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX1P40424 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX1P40424 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX1P40424 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX1P40424 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX1P40424 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX1P40424 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX1P40424 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX1P40424 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX1P40424 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX1P40424 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX1P40424 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PBX1P40424 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX1P40424 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX1P40424 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX1P40424 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX1P40424 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX1P40424 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX1P40424 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX1P40424 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX1P40424 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX1P40424 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX1P40424 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX1P40424 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX1P40424 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX1P40424 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX1P40424 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX1P40424 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX1P40424 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX1P40424 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX1P40424 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX1P40424 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX1P40424 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX1P40424 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX1P40424 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX1P40424 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX1P40424 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX1P40424 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX1P40424 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX1P40424 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX1P40424 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX1P40424 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX1P40424 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX1P40424 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX1P40424 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX1P40424 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX1P40424 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX1P40424 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX1P40424 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX1P40424 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX1P40424 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX1P40424 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX1P40424 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX1P40424 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX1P40424 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX1P40424 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX1P40424 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX1P40424 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX1P40424 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX1P40424 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX1P40424 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms