Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHKAP35790 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHKAP35790 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHKAP35790 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHKAP35790 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHKAP35790 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHKAP35790 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHKAP35790 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHKAP35790 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHKAP35790 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHKAP35790 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHKAP35790 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKAP35790 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKAP35790 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKAP35790 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKAP35790 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKAP35790 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKAP35790 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKAP35790 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKAP35790 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKAP35790 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKAP35790 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKAP35790 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKAP35790 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKAP35790 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKAP35790 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKAP35790 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHKAP35790 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHKAP35790 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHKAP35790 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHKAP35790 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHKAP35790 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHKAP35790 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHKAP35790 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHKAP35790 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHKAP35790 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHKAP35790 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHKAP35790 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHKAP35790 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHKAP35790 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHKAP35790 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHKAP35790 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHKAP35790 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHKAP35790 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHKAP35790 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHKAP35790 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHKAP35790 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHKAP35790 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHKAP35790 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKAP35790 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKAP35790 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKAP35790 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKAP35790 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKAP35790 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKAP35790 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKAP35790 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHKAP35790 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKAP35790 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKAP35790 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKAP35790 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKAP35790 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKAP35790 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKAP35790 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKAP35790 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKAP35790 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKAP35790 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKAP35790 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHKAP35790 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHKAP35790 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHKAP35790 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHKAP35790 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHKAP35790 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHKAP35790 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHKAP35790 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHKAP35790 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHKAP35790 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHKAP35790 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHKAP35790 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHKAP35790 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHKAP35790 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHKAP35790 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHKAP35790 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHKAP35790 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHKAP35790 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKAP35790 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKAP35790 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKAP35790 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKAP35790 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKAP35790 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKAP35790 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKAP35790 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKAP35790 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKAP35790 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHKAP35790 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKAP35790 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKAP35790 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKAP35790 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKAP35790 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKAP35790 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHKAP35790 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms