Protein–RNA interactions for Protein: P35250

RFC2, Replication factor C subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC2P35250 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC2P35250 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC2P35250 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC2P35250 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC2P35250 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC2P35250 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC2P35250 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC2P35250 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC2P35250 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC2P35250 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC2P35250 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC2P35250 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC2P35250 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC2P35250 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC2P35250 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC2P35250 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC2P35250 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC2P35250 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC2P35250 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC2P35250 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC2P35250 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC2P35250 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC2P35250 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC2P35250 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC2P35250 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC2P35250 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC2P35250 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC2P35250 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC2P35250 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC2P35250 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC2P35250 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RFC2P35250 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC2P35250 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC2P35250 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC2P35250 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC2P35250 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC2P35250 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC2P35250 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC2P35250 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC2P35250 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC2P35250 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RFC2P35250 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC2P35250 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC2P35250 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC2P35250 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC2P35250 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC2P35250 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC2P35250 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC2P35250 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC2P35250 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC2P35250 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC2P35250 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RFC2P35250 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC2P35250 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC2P35250 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC2P35250 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC2P35250 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC2P35250 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC2P35250 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC2P35250 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC2P35250 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC2P35250 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC2P35250 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC2P35250 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC2P35250 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFC2P35250 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC2P35250 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC2P35250 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC2P35250 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC2P35250 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC2P35250 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC2P35250 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC2P35250 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC2P35250 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFC2P35250 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RFC2P35250 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RFC2P35250 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RFC2P35250 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RFC2P35250 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC2P35250 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC2P35250 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC2P35250 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC2P35250 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC2P35250 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC2P35250 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC2P35250 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC2P35250 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFC2P35250 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC2P35250 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC2P35250 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC2P35250 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC2P35250 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC2P35250 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC2P35250 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC2P35250 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC2P35250 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC2P35250 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC2P35250 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFC2P35250 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFC2P35250 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms