Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTNNB1P35222 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms