Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNA1P35221 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNA1P35221 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms