Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCD1P33897 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ABCD1P33897 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCD1P33897 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms