Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHRNA3P32297 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHRNA3P32297 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms