Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA9P31269 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA9P31269 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA9P31269 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms