Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP5DP30049 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5DP30049 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms